به گزارش سایت فدراسیون و به نقل از روابط عمومی سازمان لیگ فوتبال ایران، مراسم قرعه کشی دوازدهمین لیگ برتر فوتبال بانوان فصل ۱۴۰۰-۱۳۹۹  با حضور لیلا صوفی زاده نایب رئیس بانوان فدراسیون فوتبال، سهیل مهدی مدیر مسابقات سازمان لیگ، گلاره ناظمی مسئول فوتبال بانوان سازمان لیگ، امیرحسین فراهانی، بهنام محمودزاده از مسئولان مسابقات  و نمایندگان ۱۲ باشگاه لیگ برتر بانوان در سالن روابط عمومی سازمان لیگ فوتبال ایران برگزار شد.
مسابقات لیگ برتر فوتبال بانوان در دو گروه ۶ تیمی برگزار می شود مسابقات از ۷ آذر ۱۳۹۹ آغاز می شود. گروه های تیم ها به شرح زیر بر اساس قرعه تعیین شدند: